En considérant la proximité au tropique du Capricorne, le climat de Misiones, c' est subtropical avec saison sèche, il s' agit d' une des provinces plus humides du pays, d' habitude sans variations remarquables dans le territoire. L' amplitude thermique - différence entre la température moyenne du mois plus chaud, janvier et celle du mois plus froid, juillet - 10^º. Les vents prédominants sont ceux du nord-est, du sud-est et de l' est. Au printemps, vers octobre,et en été, vers janvier, les pluies plus abondants tombent. Les gelées sont réguliers et ils ont lieu dans les zones plus élevées.

Température moyenne annuelle 21,5^º C. Précipitations moyennes annuelle 1700mm.